ソフトウェア講習会（5・6月開催）のお知らせ / Announcement Application Software Training Sessions (May-June)
(English follows Japanese)
九州大学 情報基盤研究開発センター 研究用計算機システムニュース No.591
2026.04.16
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情報基盤研究開発センター研究用計算機システムＷＷＷホームページ
https://www.cc.kyushu-u.ac.jp/scp/
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◆ ソフトウェア講習会（5・6月開催）のお知らせ /
Announcement: Application Software Training Sessions (May-June)
情報基盤研究開発センターでは 5～6月にかけて以下の講習会を開催します。
・AMBER講習会（5/25)
・MATLAB講習会（6/2～4）
・Mathematica講習会（6/5）
・Nastran/Patran講習会（6/8）
・AVS/Express講習会（6/9）
各講習会の詳細、および申し込み方法は以下をご参照ください。
The Research Institute for Information Technology will hold the following training sessions in May and June:
- AMBER (May 25)
- MATLAB (June 2-4)
- Mathematica (June 5)
- Nastran/Patran (June 8)
- AVS/Express (June 9)
Please refer to the following article for detailed information and application of them.
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■AMBER講習会
日程：5月25日（月）13:00～17:00
場所：九州大学 情報基盤研究開発センター 2階 セミナー室（210）
概要：
Amberは分子力学・動力学計算シミュレーションプログラムのパッケージです。
溶媒水分子の配置や電荷のフィッティングを行なうビルダーモジュールなどのプログラムが多数用意されています。
内容：(実習あり)
Jupyter notebookの説明
トポロジーおよび座標ファイルの作成
・タンパク質の力場の読み込み
・アラニン・ジペプチド系の構築
・Amberのprmtopとinpcrd入力ファイルの保存
分子動力学計算の実行
・構造最適化の設定入力および実行
・昇温の設定入力および実行
・プロダクション行程の入力および実行
ログの解析
動力学計算の結果の解析
・トラジェクトリーのRMSD解析
Amberパラメーターの詳細
・一般有機分子パラメーターの調製
・PDB形式ファイルの入手およびAmber用に修正
・たんぱく質と有機分子を含む系の構築
シミュレーションの実行
定員：10名
□詳細・申し込み
https://forms.cloud.microsoft/r/jCAXwt3mrG
※入力された個人情報は講習会開催にかかる事務処理にのみ利用します。
申込締切：5月18日(月)
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■MATLAB講習会
日程：6月2日（火）～ 4日（木）9:00～17:00（お昼休憩12:00～13:00）
場所：オンライン開催(Teams)
内容：
MATLAB のテクニカル コンピューティング環境を総合的に学ぶことができる講習会です。
詳細は下記URLをご覧ください。
https://jp.mathworks.com/learn/training/matlab-fundamentals.html
□詳細・申し込み
https://forms.cloud.microsoft/r/LyAinf7N6n
※入力された個人情報は講習会開催にかかる事務処理にのみ利用します。
申込締切：5月19日(火)
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■Mathematica講習会
日程：6月5日（金）13:30～17:00
場所：オンライン開催(Teams)
内容：
〇導入
Mathematicaを使ってできることの一部を紹介
〇基礎
式の入力方法や計算の実行方法などのノートブックの使い方、 変数に値を代入する方法や関数定義などのプログラミングの基礎などの Mathematicaの基本的な使い方について説明
〇数式処理・数値解析
多項式方程式を解いて解を可視化する方法や、微分積分の計算方法、 微分方程式を解く方法を説明
〇データサイエンス
データ取り込み、解析、レポート/可視化の実行ワークフローを 気象庁の過去の気温データを読み込み可視化する例を紹介
- Mathematicaにオープンデータを読み込む
- 読み込んだデータからグラフを作成する
〇機械学習
初心者でも簡単に機械学習のソリューションが実装でき、上級者は開発時間が短縮できるように
設計されているMathematicaの機械学習 の例を紹介
- 手書き文字を認識するニューラルネットワークを作成
□詳細・申し込み
https://forms.cloud.microsoft/r/2aSRBPGU70
※入力された個人情報は講習会開催にかかる事務処理にのみ利用します。
申込締切：5月29日(火)
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■Nastran/Patran講習会
日程：6月8日（月）10:00～17:00（お昼休憩12:00～13:00）
場所：オンライン開催(Teams)
概要：
MSC Nastran（ソルバー）とPatran（プリポスト）を用いて、構造解析の基礎知識から
具体的な操作／実行方法までをワークショップ形式中心で解説します。
※講習内容とは別の個別テーマについてのご質問はご遠慮ねがいます。
内容：(実習あり)
・MSC NastranとPatranの基礎
・梁構造の線形静解析
・シェル構造の線形静解析
・ソリッド構造の線形静解析
・固有値解析
実習：
受講者には事前にMSC Nastran/Patran のStudent Edition を配布します。
講習前にご自身でソフトのインストール・起動確認をお願いします。
＜パソコン環境の条件＞
・Windows11 Pro
・メモリ 8GB以上
・ハードディスク 空き1GB以上
・グラフィックカード NVIDIA Quadro シリーズクラス
・3ボタンのマウス
・1280×1024以上の解像度
・Microsoft Teamsを使用できること
・複数ディスプレイ使用を推奨（1枚はTeams講義画面を表示し、もう1枚で実習が可能な状態）
トレーニング資料は電子データで配布します。必要に応じてご自身で印刷等を行ってください。
□詳細・申し込み
https://forms.cloud.microsoft/r/mzWuTeiN6Y
※入力された個人情報は講習会開催にかかる事務処理にのみ利用します。
申込締切：6月1日(月)
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■AVS/Express講習会
日程：6月9日（火）13:30-16:30
場所：オンライン開催(Teams)
内容：
※第二部の「例」については変わる可能性もございます。
□第一部：基礎演習（13:30-15:00）
・AVS/Express 概要、起動方法、基本操作
・各種可視化手法（等値面、断面、ベクトル、流線など）
…………＜10分休憩＞…………
□第二部：気象データを例にした可視化例（15:10-16:30）
・気象データハンドブックの紹介
・地図、地形データの追加（地形データの用意・位置合わせ）
・雲の表現（様々なボリューム表示）
・アニメーション、動画作成（Animator,連番画像からの動画作成）
□詳細・申し込み
https://forms.cloud.microsoft/r/HRRE68xJ56
※入力された個人情報は講習会開催にかかる事務処理にのみ利用します。
申込締切：6月2日(火)
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[問い合わせ窓口]
九州大学 情報統括本部 HPC事業室
Mail: request(at)iii.kyushu-u.ac.jp ※(at)は＠に置き換え
(This is translated using the AI translator DeepL)
Kyushu University RIIT Supercomputer News No.591 (2026.04.16)
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RIIT Supercomputer System Web
https://www.cc.kyushu-u.ac.jp/scp/
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◆ Announcement: Application Software Training Sessions (May-June)
The Research Institute for Information Technology will hold the following training sessions in May and June.
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■AMBER Training Session
Date: May 25 (Mon) 1:00 PM – 5:00 PM
Location: Seminar Room on the Second Floor, Research Institute for Information Technology, Kyushu University
Overview:
Amber is a package of molecular mechanics and molecular dynamics simulation programs.
It provides a wide range of tools, including builder modules for arranging solvent water molecules and fitting charges.
Contents: (Hands-on session included)
• Introduction to Jupyter notebooks
• Creation of topology and coordinate files
- Loading protein force fields
- Construction of an alanine dipeptide system
- Saving Amber input files (prmtop and inpcrd)
• Running molecular dynamics simulations
- Input setup and execution of structure minimization
- Input setup and execution of heating
- Input setup and execution of the production phase
• Log file analysis
• Analysis of molecular dynamics results
- RMSD analysis of trajectories
• Details of Amber parameters
- Preparation of general organic molecule parameters
- Obtaining PDB files and modifying them for Amber
- Construction of systems including proteins and organic molecules
• Execution of simulations
Capacity: 10 participants
□Details and Registration
https://forms.cloud.microsoft/r/jCAXwt3mrG
※The personal information you provide will only be used for administrative purposes related to the training.
Application deadline: May 18 (Mon)
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■MATLAB Training Session
Date: June 2 (Tue) – June 4 (Thu), 9:00 AM – 5:00 PM
(Lunch break from 12:00 PM to 1:00 PM)
Location: Online (Teams)
Content:
This training provides a comprehensive learning experience of MATLAB’s technical computing environment.
For details, please refer to the following URL:
https://jp.mathworks.com/learn/training/matlab-fundamentals.html
□Details and Registration
https://forms.cloud.microsoft/r/LyAinf7N6n
※The personal information you provide will only be used for administrative purposes related to the training.
Application deadline: May 19 (Tue)
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■Mathematica Training Session
Date: June 5 (Fri) 1:30 PM – 5:00 PM
Location: Online (Teams)
Content:
〇Introduction
An overview of what can be done using Mathematica
〇Basics
Explanation of fundamental Mathematica usage, including how to use notebooks, input expressions, execute calculations, assign values to variables, and define functions
〇Symbolic and Numerical Calculations
How to solve polynomial equations and visualize solutions, perform differentiation and integration, and solve differential equations
〇Data Science
Introduction to data import, analysis, and reporting/visualization workflows using an example of importing
and visualizing past temperature data from the Japan Meteorological Agency
- Importing open data into Mathematica
- Creating graphs from imported data
〇Machine Learning
Examples of Mathematica’s machine learning capabilities, which allow beginners to easily implement solutions and enable advanced users to reduce development time
- Creating a neural network to recognize handwritten characters
□Details and Registration
https://forms.cloud.microsoft/r/2aSRBPGU70
※The personal information you provide will only be used for administrative purposes related to the training.
Application deadline: May 29 (Tue)
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■Nastran/Patran Training Session
Date: June 8 (Mon) 10:00 AM – 5:00 PM
(Lunch break from 12:00 PM to 1:00 PM)
Location: Online (Teams)
Overview:
This training focuses on MSC Nastran (solver) and Patran (pre/post-processor), covering topics from basic structural analysis concepts to practical operation and execution through hands-on exercises.
※Questions on individual topics outside the scope of the training content are not accepted.
Contents: (Hands-on session included)
• Basics of MSC Nastran and Patran
• Linear static analysis of beam structures
• Linear static analysis of shell structures
• Linear static analysis of solid structures
• Eigenvalue analysis
Hands-on Exercises:
Participants will receive the Student Edition of MSC Nastran/Patran in advance.
Please install the software and confirm that it runs properly before the training.
<System Requirements>
• Windows 11 Pro
• Memory: 8 GB or more
• Hard disk: at least 1 GB of free space
• Graphics card: NVIDIA Quadro series class
• Three-button mouse
• Resolution: 1280×1024 or higher
• Ability to use Microsoft Teams
• Use of multiple displays is recommended
(one for Teams lectures and one for hands-on work)
Training materials will be distributed electronically. Please print them if necessary.
□Details and Registration
https://forms.cloud.microsoft/r/mzWuTeiN6Y
※The personal information you provide will only be used for administrative purposes related to the training.
Application deadline: June 1 (Mon)
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■AVS/Express Training Session
Date: June 9 (Tue) 1:30 PM – 4:30 PM
Location: Online (Teams)
Content:
*The examples in Part 2 are subject to change.*
□Part 1: Basic Exercises (1:30 PM – 3:00 PM)
• Overview of AVS/Express, startup procedures, and basic operations
• Various visualization techniques (isosurfaces, cross sections, vectors, streamlines, etc.)
…………＜10-minute break＞…………
□Part 2: Visualization Examples Using Weather Data (3:10 PM – 4:30 PM)
• Introduction to the Meteorological Data Handbook
• Adding maps and terrain data (preparing terrain data and alignment)
• Cloud representation (various volume rendering methods)
• Animation and video creation
(Animator, creating videos from sequential images)
□Details and Registration
https://forms.cloud.microsoft/r/HRRE68xJ56
※The personal information you provide will only be used for administrative purposes related to the training.
Application deadline: June 2 (Tue)
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[Inquiries to:]
HPC Working Group, Information Infrastructure Initiative, Kyushu University
Mail: request(at)iii.kyushu-u.ac.jp *(at) is replaced by @.