Amber講習会2024
講習会の内容
AMBERは分子力学・動力学計算シミュレーションプログラムのパッケージです。溶媒水分子の配置や電荷のフィッティングを行なうビルダーモジュールなどのプログラムが多数用意されています。
※ノートパソコン等をお持ち込みください。
※※実習でインターネット環境が必要となりますので、ご準備をお願いいたします。
wifi環境として、kitenetおよびeduroamはご利用いただけます。
内容：(実習あり)
Jupyter notebookによる電子ノートブックを作成して作業を行います。
・分子動力学計算概要
・Jupyter notebookの説明
・ペプチド構造の構築
・構造最適化と分子動力学計算(実溶媒中)
・計算ログ解析
・トラジェクトリー解析
・様々なPDBファイルの読み込み
・実習、実例紹介
・Q&A
開催日時・会場・定員
2024年11月6日（水）13:00-17:00
九州大学 伊都キャンパス 情報基盤研究開発センター 2階 203多目的教室
アクセス方法 https://www.cc.kyushu-u.ac.jp/scp/access.html
参加条件
- 参加資格者は、国内に在住の国公私立大学・高専の教員・学生・研究生、研究機関研究員、企業に所属する研究者・技術者です。
- 日本国籍もしくは永住権を持たない方、日本の非居住者、特定類型に該当する方は受講できません