GAMESS

最終更新日：2024年11月27日

GAMESS（The General Atomic and Molecular Electronic Structure System）は、 非経験的分子軌道法／密度汎関数理論計算プログラムです。 多種多様な波動関数と基底関数により、分子の化学的特性の計算を行なうことができます。 並列実行も可能です。


利用範囲

九州大学構成員 学術研究機関構成員 民間利用の方
OK OK OK


モジュール

モジュール名 バージョン
gamess 30 Sep 2023（R2）

モジュールの利用法は以下を参照してください。

モジュール利用法

利用方法

環境設定

$ module load intel
$ module load impi
$ module load gamess


作業用ディレクトリ

以下の手順で、作業用ディレクトリをホームディレクトリに作成してください。

$ mkdir ~/scr


入力ファイルの拡張子

GAMESS への入力ファイルの拡張子は、必ず、".inp"にしてください。


実行方法

#!/bin/bash
#PJM -L rscgrp=a-batch
#PJM -L node=2
#PJM -L vnode-core=36
#PJM -L elapse=1:00:00
#PJM -j


module load intel
module load impi
module load gamess > output


$GAMESS_DIR/rungms exam01 00 36 18


リソースグループ名を a-batch に設定
使用するノード数を 2 に設定
ノードあたりコア数指定
最大経過時間を1時間に設定
標準出力と標準エラー出力を同じファイルに

環境設定

GAMESS の実行

このスクリプトでは，2ノード（2×18コア）を使用して、exam01.inp を入力データとした 36 並列実行を指定をしています。 GAMESS 実行スクリプト rungms の引数は以下の意味を持っています。

引数番号 説明
第1引数 入力ファイル名（拡張子".inp"を除く）
第2引数 GAMESSのバージョン（00固定）
第3引数 並列度
第4引数 ノードあたりのプロセッサ（コア）数

GAMESSの出力結果は標準出力に出力されます。

output の部分は出力結果をoutputに書き込み指定をしています。


参考資料


マニュアル

GAMESSのホームページ http://www.msg.ameslab.gov/GAMESS/GAMESS.html から、マニュアルを含むの詳細な情報を得ることができます。